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La toma de muestras de ADN en el medio ambiente se actualiza y pasa a una nueva tecnología de código abierto

Científicos del Laboratorio Oceanográfico y Meteorológico del Atlántico (AOML) de la NOAA, del Instituto Cooperativo de Estudios Marinos y Atmosféricos (CIMAS) de la Escuela de Ciencias Marinas y Atmosféricas de la Universidad de Miami y del Instituto del Golfo Norte de la Universidad Estatal de Misisipi han diseñado un nuevo instrumento que proporcionará valiosa información sobre la biodiversidad de los ecosistemas acuáticos. Un artículo publicado recientemente en Hardware X describe el diseño y la creación de un muestreador automatizado de ADN ambiental (ADNe) subsuperficial (SASe), de bajo coste y de código abierto, para tomar muestras de ADNe en la columna de agua. El SASe representa un hito para el AOML, ya que es una de las primeras piezas tecnológicas que pasan por un riguroso proceso de transición desde los escritorios de los científicos en el laboratorio, pasando por los canales de aprobación de la organización, hasta llegar a la comunidad científica en general, con plena accesibilidad al público.

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Los corales urbanos persisten en lugares insólitos

Cuando observamos el estado de los corales en todo el mundo, puede ser difícil ver un resquicio de esperanza, pero un reciente artículo publicado en Frontiers in Marine Science muestra la esperanza de los corales en lugares improbables. En el estudio, científicos del Laboratorio Oceanográfico y Meteorológico del Atlántico (AOML) de la NOAA y del Instituto Cooperativo de Estudios Marinos y Atmosféricos (CIMAS) de la Escuela Rosenstiel de Ciencias Marinas y Atmosféricas de la Universidad de Miami compararon los procesos moleculares de los corales cerebro (Pseudodiploria strigosa) que viven en aguas urbanas del Puerto de Miami con los corales de alta mar de Emerald Reef. Descubrieron que los corales urbanos se habían adaptado a unas condiciones difíciles que les ayudaban a diferenciar y consumir partículas de alimento sanas frente a los organismos enfermos.

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Puesta de sol en la playa. Crédito de la foto: NOAA AOML.

Resolver un misterio de ADN electrónico con el Instituto del Golfo Norte

De la mesa de CSI: Miami (edición para peces): Resolver un misterio de ADN electrónico. El profesor de investigación asociado del NGI, Luke Thompson, y el asociado postdoctoral del NGI, Sean Anderson, han estado estudiando el ADN ambiental (ADNe) que dejan los peces en el muelle de la Universidad de Miami (en la foto), cerca del Laboratorio Oceanográfico y Meteorológico del Atlántico de la NOAA, en Miami (Florida). Cuando analizaron los datos, aunque muchas de las especies de peces detectadas eran las esperadas para la zona, les sorprendieron varias especies inesperadas, como la trucha arco iris. Para ayudar a resolver este misterio, Luke y Sean enviaron una encuesta a los biólogos de peces con experiencia en esta región.

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El Instituto del Golfo Norte aporta nuevas tecnologías a las encuestas de pesca

De marzo a mayo, el asociado postdoctoral del NGI Sean Anderson está participando en dos etapas de un estudio de la NOAA Fisheries en el Golfo de México a bordo del buque Piscis de la NOAA. El proyecto de la NOAA, "Environmental DNA Enhancement of Fisheries Independent Monitoring Cruises for Ecosystem Based Fisheries Management", pretende mejorar la gestión pesquera basada en el ecosistema (EBFM) con el uso de la secuenciación del ADN ambiental (eDNA). Las cámaras trampa (en la foto) colocadas en el fondo marino del Golfo de México captan en vídeo el paso de los peces, mientras que las botellas recogen el agua de mar por la que han pasado los peces, dejando rastros de ADN.

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La importancia de los 'Ómicos en la investigación de la NOAA

En febrero de 2020, se lanzó la "Estrategia Omics" de la NOAA. La Estrategia fue informada por un documento técnico que recientemente estuvo disponible en el Repositorio Institucional de la NOAA. Este documento titulado 'Libro Blanco Omics' de la NOAA: Informando la 'Estrategia Ómica y Plan de Implementación de la NOAA, identifica las prioridades de la NOAA en la 'investigación Ómica, promueve la integración y la comunicación entre las oficinas de línea, y propone posibles soluciones a los desafíos de implementación en este sector de investigación de rápido avance.

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Playa al amanecer

Actualización del Estudio BEACHES: Los niños que visitan las playas con heridas abiertas son más susceptibles a las infecciones bacterianas

Un nuevo artículo que aparece en el International Journal of Environmental Research and Public Health examina cómo la presencia de heridas abiertas y abrasiones de los niños durante el juego en la playa puede ponerlos en mayor riesgo de infecciones de la piel por bacterias marinas y otros patógenos con los que se encuentran. El estudio concluye que los niños con heridas existentes o recién adquiridas mientras están en la playa son más susceptibles a las infecciones.

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La investigadora de corales del CIMAS, Stephanie Rosales, está explorando cómo los cambios físicos del hábitat impactan en los corales. Crédito de la foto: NOAA AOML.

Dos tipos de bacterias relacionadas con la enfermedad de la pérdida de tejido de los corales pétreos sugieren cómo podría propagarse esta enfermedad mortal

Una nueva investigación sobre la enfermedad de la pérdida de tejido de los corales pétreos revela por primera vez "firmas bacterianas" similares entre los corales enfermos y el agua y los sedimentos cercanos. Los resultados insinúan cómo podría propagarse esta enfermedad mortal, y qué bacterias están asociadas a ella, en el arrecife de coral de Florida.

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La NOAA estrena estrategias centradas en la ciencia y la tecnología emergentes

En la reunión internacional de Ciencias Oceánicas de 2020, la microbióloga del AOML Kelly Goodwin ayudó a la NOAA a desvelar una nueva estrategia para que la agencia amplíe drásticamente su uso de los "Ómicos" en los próximos años. La estrategia "Omics" es uno de los cuatro proyectos que la NOAA estrenó y que guiará los avances transformadores en la calidad y oportunidad de su ciencia, productos y servicios. 

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Mes de la Historia de la Mujer: Omics con Kelly Goodwin

En honor al Mes de la Historia de la Mujer, NOAA Research recientemente presentó a la microbióloga del AOML, Kelly Goodwin, en un artículo que da a los lectores una mirada dentro de la vida diaria de un investigador. Kelly es copresidenta del grupo de trabajo que está diseñando el plan para implementar la Estrategia Ómica de la NOAA, una de las cuatro estrategias de ciencia y tecnología que tienen como objetivo guiar los avances transformadores en la calidad y la puntualidad de la ciencia, los productos y los servicios de la NOAA.

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Una red de arrastre de macroplancton equipada con Visión Profunda, un sistema de cámaras que recoge imágenes continuas de los organismos que pasan, se lleva a cubierta después de recoger peces de la zona mesopelágica.

AOML y científicos noruegos utilizan el eDNA para estudiar los peces mesopelágicos

El Dr. Luke Thompson, profesor asistente de investigación del Instituto del Golfo Norte en el AOML, navegó a bordo del rompehielos noruego RV Kronprins Haakon en mayo como parte de un esfuerzo de investigación centrado en la caracterización de las especies que habitan en la zona mesopelágica, la región del océano que se encuentra a 200-1000 metros bajo la superficie. El crucero se llevó a cabo para explorar el potencial de desarrollo de una nueva pesquería basada en peces mesopelágicos.

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