Resolver un misterio de ADN electrónico con el Instituto del Golfo Norte

Publicado originalmente en el Instituto del Golfo Norte el 15 de marzo de 2021.

De la mesa de CSI: Miami (edición para peces): Resolver un misterio de ADN electrónico. El profesor de investigación asociado del NGI, Luke Thompson, y el asociado postdoctoral del NGI, Sean Anderson, han estado estudiando el ADN ambiental (ADNe) que dejan los peces en el muelle de la Universidad de Miami (en la foto), cerca del Laboratorio Oceanográfico y Meteorológico del Atlántico de la NOAA, en Miami (Florida). Cuando analizaron los datos, aunque muchas de las especies de peces detectadas eran las esperadas para la zona, les sorprendieron varias especies inesperadas, como la trucha arco iris. Para ayudar a resolver este misterio, Luke y Sean enviaron una encuesta a los biólogos de peces con experiencia en esta región.

Recogida de muestras de ADN electrónico para resolver un misterio en el muelle de la Universidad de Miami. Crédito de la imagen: Northern Gulf Institute.

La respuesta fue abrumadora: recibieron más de 20 respuestas a la encuesta y correos electrónicos de expertos a-ionados en peces dispuestos a compartir sus conocimientos sobre los peces del sur de Florida. Basándonos en esta respuesta de los expertos y en nuestra propia investigación, 31 de las 40 secuencias de peces más abundantes pudieron ser contabilizadas como nativas de las aguas del sur de Florida a nivel de género o al nivel más bajo asignado. En cuanto a las secuencias no autóctonas, incluida la secuencia abundante asignada como Oncorhynchus mykiss (trucha arco iris), muchos de los encuestados conjeturaron que este ADN podría proceder de partes de peces vertidas en las cercanías, y varios mencionaron el Miami Seaquarium. Luke y Sean confirmaron posteriormente con el conservador del Seaquarium que, efectivamente, todas las noches arrojan partes sobrantes de tres peces de alimentación: Oncorhynchus mykiss, Clupea harengus (arenque) y miembros de Osmeridae (capelines y esmerejones), que se encontraban entre las secuencias más abundantes observadas, respectivamente. Otras dos secuencias no autóctonas, asignadas a Ammodytes spp. (lanzas de arena), pueden proceder de peces de cebo habituales en las actividades pesqueras en torno a Bear Cut.

Caso cerrado! Vea la reciente publicación que describe un método de muestreo actualizado para el ADNe.